Αυτή η υπερτροφή έχει επίσης αντενδείξεις. Σε ορισμένες περιπτώσεις, το σκόρδο μπορεί να είναι επικίνδυνο. Η υπερβολική κατανάλωση σκόρδου δεν συνιστάται κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης και του θηλασμού. Τα παιδιά κάτω των 7 ετών θα πρέπει επίσης να το καταναλώνουν εξίσου.
Δεν πρέπει να καταναλώνετε σκόρδο δύο εβδομάδες πριν από προγραμματισμένες χειρουργικές επεμβάσεις: αραιώνει το αίμα και μπορεί να προκαλέσει αιμορραγία. Σε επαφή με το δέρμα, το σκόρδο και τα προϊόντα με βάση το σκόρδο μπορεί να προκαλέσουν ένα φαινόμενο που μοιάζει με κάψιμο. Συμβουλευτείτε έναν γιατρό πριν από τη χρήση.
Είναι δηλητηριώδες για τα ζώα. Ειδικά για γάτες και σκύλους ιαπωνικών φυλών (Akita Inu, Shiba Inu). Οι γιατροί λένε ότι ένα υγιές άτομο μπορεί να καταναλώνει με ασφάλεια έως και 4 σκελίδες σκόρδο την ημέρα και να αισθάνεται καλά..